Федерация самбо Словацкой Республики была зарегистрирована 31 октября 2006 года. С 2003 года велась работа по проведению тренировок и поиску волонтеров для становления самбо в Словакии.
В 2007 году в Словакии удалось организовать и провести мастер-класс для европейских спортсменов и тренеров. Семинар проводил заслуженный мастер спорта России, многократный чемпион мира по боевому самбо Федор Емельяненко.
В 2007 году на чемпионате Европы в Болгарии два представителя сборной Словакии стали бронзовыми призерами в соревнованиях по боевому самбо.
С 2008 года по настоящее время на международных турнирах, проводимых на словацкой земле, вручается специальный «Кубок Федора Емельяненко» в тяжелой весовой категории по спортивному и боевому самбо (по согласованию с учредителем приза).
Президентом ФССР со дня основания и по сегодняшний день является Игорь Шашурин – дважды чемпион мира, дважды серебряный и бронзовый призер чемпионата мира среди мастеров.
В 2012 году ФССР проводит традиционные соревнования в новом формате командного турнира («стенка на стенку»).